L'edifici0, anticamente delle monache Cappuccine, risale alla fine del XVI secolo. Notevoli opere di ristrutturazione furono eseguite alla metà del XVIII secolo su progetto di Domenico Morelli. E' attribuito a Cosimo Morelli l'oratorio interno del convento (1762). All'inizio del XX secolo il complesso è stato sede di orfanotrofio femminile, mentre oggi vi trovano spazio diverse associazioni. La chiesa è utilizzata come spazio per mostre.

Fonti manoscritte 

Giovanni Nicolò Villa, Pitture della città d'Imola ... , 1794 (Imola, Biblioteca comunale, Mss. Imol. 43), c. 373B, pubblicato in Pitture della città d'Imola ... A cura di Claudia Pedrini. Imola, La mandragora, 2001

Gaetano Giordani, Memorie manoscritte intorno alle vite ed alle opere de' pittori scultori architetti eccetera Raccolte da Gaetano Giordani nell'anno 1826, sec. XIX (Bologna, Biblioteca comunale dell'Archiginnasio, Manoscritto B. 1809),  p. 7 di "Memorie intorno alla vita ed alle opere del cavaliere Cosimo Morelli architetto d'Imola", pubblicato in Memorie manoscritte intorno alle vite ed alle opere de' pittori scultori architetti eccetera d'Imola raccolte da Gaetano Giordani nell'anno 1826. A cura di Matteo Bacci e Francesca Grandi. Imola, La mandragora, 2006, p. 131

Opere a stampa

Anna Maria Matteucci, Denna Lenzi, Cosimo Morelli e l'architettura delle legazioni pontificie, Imola, Santerno, University Press, 1977, p. 272

Monica Bietti, La Santissima Annunziata delle Cappuccine di Imola, in Donzelle e cappuccine: il Conservatorio delle donzelle nel Convento della SS. Annunziata a Imola, a cura di Monica Bietti e Giampiero Cammarota, Bologna, Nuova Alfa, 1985, pp. 23-62. (Collana Rapporti) Catalogo della mostra allestita a Imola, ex chiesa della SS. Annunziata nel 1985

Chiesa e convento della SS. Annunziata, in Sui sentieri dello spirito. Tutte le chiese della diocesi, a cura di Alessio Mazzini, Angelo Visani, Imola, CARS, Il nuovo diario messaggero, 2000, p. 81

Chiesa e convento dell'Annunziata, in Imola al tempo delle legazioni. Itinerari settecenteschi nella città, Imola, Associazione turistica Pro loco di Imola, 2002, p. 60

Giuliano Giovannini, Il monastero delle cappuccine in Imola col titolo della SS. Annunziata, in "Pagine di vita e storia imolese", 11 (2007), pp. 119-134

Tesori di sacrestia di chiese soppresse della Diocesi di Imola, a cura di Alessio Mazzini, Marco Violi, Imola, La mandragora, 2010, pp. 91-93